A Casa das Ciências possui protocolos de colaboração com algumas entidades com quem tem vindo a estabelecer parcerias de acção conjunta de diferentes modos, ao longo do tempo. Estão neste caso:
Os "Portais Amigos" são um dos componentes estruturantes do portal no que diz respeito à sua definição de qualidade, com contributos de reconhecida competência científica e didáctica, publicados sob a égide da Coordenação e Comissão Editorial.
Significa isto que, ao longo do tempo, se foram estabelecendo parcerias com personalidades e instituições em todo o mundo, que tivessem publicado materiais de qualidade e reconhecimento universal, e a quem foi solicitada autorização para traduzir/adaptar esses materiais para língua portuguesa.